Projektziel war die Entwicklung von Auswerte-Pipelines zur automatisierten Analyse von Hochdurchsatzdaten. Dadurch soll ein schnellerer Transfer aktueller wissenschaftlicher Erkenntnisse in die praktische Anwendung erfolgen.

Diese Pipelines sollen zur Effizienzsteigerung bei der Auswertung wissenschaftlicher Projekte dienen als auch die Reproduzierbarkeit und Vergleichbarkeit erhaltener Ergebnisse sichern.

Zudem sollten wertvolle Erkenntnisse bezüglich des effizienten und hochqualitativen Wissenschaftstransfers in der Bioinformatik gewonnen und der wissenschaftlichen Community zur Verfügung gestellt werden.

In einer Kooperation mit der HTW sollte die dort vorhandene hohe Fachkompetenz im Bereich der Softwareentwicklung mit einer umfangreichen Erfahrung in der automatisierten Analyse von Hochdurchsatzdaten im BI-Support am RKI verknüpft werden.

Die entstehenden Pipelines sollen unter einer Open-Source-Lizenz zur Nachnutzung durch die gesamte wissenschaftliche Community bereitgestellt werden.

Des Weiteren war die Veröffentlichung von Publikationen sowohl zu den Pipelines, als auch zu dem Vorgehen, welches als Muster für die kooperative Entwicklung hochqualitativer wissenschaftlicher Software dienen kann, beabsichtigt.

• Prof. Dr.-Ing. Piotr Wojciech Dabrowski (Projektleitung)

• Fynn Freyer (Projektmitarbeiter_in)

Robert Koch-Institut (RKI)